header image  
МОЛЕКУЛЯРНО ДИНАМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ  
line decor
  
line decor
 
 
 
 

 
 

Что такое SAGEMD


SageMD - это программный пакет для молекулярно-динамического моделирования и мощный, удобный для пользователя инструмент молекулярной визуализации. Графический интерфейс пользователя (GUI) упрощает взаимодействие пользователя с кодом MD и обеспечивает настройку исходных данных с помощью интуитивно понятных и простых в использовании диалогов и меню. Исходные данные, результаты, параметры, ячейку MD и кристаллическую решетку можно проверить на экране компьютера. Удобный графический интерфейс также позволяет анализировать результаты с помощью различных графиков и инструментов. Код SAGEMD может использоваться для моделирования свойств материалов при постоянной температуре и / или постоянном давлении, для изучения поведения кристаллической решетки при разтяжении или сжатии, для вычисления радиальной функции распределения (RDF) и для получения коэффициентов диффузии атомов. Пользователь может выбирать различные граничные условия, а именно: периодические граничные условия, свободные поверхности и подвижные стенки. Кроме того, подход QEq для расчета межатомной энергии, учитывающий распределение атомного заряда, был включен в код SAGEMD для моделирования свойств материалов с ковалентными химическими связями. Для получения атомных зарядов и других параметров силовых полей, используемых в SAGEMD, использовались квантово-химические программы (например, GAUSSIAN, ABINIT).


ФУНКЦИИ

  • Отображение трехмерных графических моделей атомных структур
  • Простое использование построителя кристаллических решеток
  • Операции копирования, перемещения и удаления выбранных атомов
  • Вариант выбора атомов с помощью бокса, сферы, цилиндра и типа атома
  • Выбор и отмена выбора атомов щелчком мыши
  • Поворот и перемещение модели путем перемещения мыши
  • Настройка цвета и размера атомов и цвета фона
  • Расчет и отображение связей между атомами
  • Ортогональные или перспективные виды моделей
  • Возможность изменения качества рендеринга
  • Расчет расстояния и углов между атомами
  • Изменение типа выбранных атомов
  • Масштабирование моделей
  • Экспорт моделей в форматы car, xtl, fdf и xyz
  • Удобство использования диалога для отображения и редактирования местоположения и типов атомов
  • Отображение и маркировка осей решетки
  • Копирование любой части экрана SageMD в буфер обмена в виде растрового изображения
  • Отображение графика зависимости температуры от времени и отображение изменений структуры во время моделирования MD
  • Отображение графиков RDF, MSD, температуры, энергии и напряжений после моделирования MD
  • Копирование этих графиков в MS Excel и MS Word.

Чтобы узнать больше о SageMD, см. Страницу Часто задаваемых вопросов


 
 

 

SageMD

SageMD2

Моделирование свойств материала